锡林郭勒检察分院成立于1954年8月，下辖13个旗县市（区）检察院。检察机关内设机构改革后，分院设 17个内设机构和1个直属事业单位。
全盟两级检察院现有政法专项编制430个，其中分院85个，各基层院345个。两级院现有政法专项编制在编干警390人，其中分院70人，各基层院319人。现有事业编制23个，其中分院12个，各基层院11个。现有事业编制在编干警17人，其中分院10人，各基层院7人。各基层院现有工勤编制35个，现有工勤编制在编干警26人。
全盟现有员额检察官143人，占现有政法专项编制数的36.67%；现有检察辅助人员135人，占现有政法专项编制数的34.62%（其中检察官助理95人，司法警察25人，书记员10人，检察技术5人，分别占现有政法专项编制数的24.36、6.41%、2.56%和1.28%）；现有司法行政人员64人，占政法专项编制数的16.41%。
分院现有员额检察官27人，占现有政法专项编制数的38.57%；现有检察辅助人员24人，占现有政法专项编制数的34.29%；现有司法行政人员19人，占现有政法专项编制数的27.14%。
目前分院新的办公办案用房于2017年6月搬迁入住，与内蒙古检察官学院锡林郭勒盟分院前后相邻。分院新的办公办案用房布局合理、设施完备、信息化程度高，除建有12309检察服务大厅、法治教育基地、警务区、检察技术专业实验用房、诉讼档案服务中心、融媒体中心、涉案物品专门保管室专业性等技术用房外，还建有院史馆、图书室、党建活动室、食堂、检察官文体活动室、网络放映厅等辅助性设施。在地下室，建有司法警察训练靶场、双回路强电设备机房、供热换热站、消防设施、网络机房及给排水、空气能、二次给水、直饮水系统。
自建院以来，全盟两级院共荣获232个盟级以上集体表彰奖励，88名个人荣获196个盟级以上个人表彰奖励。我院先后荣获“全区学习使用蒙古语文先进集体”“扫黑除恶专项斗争先进集体”等，编撰的《蒙汉双语对照刑事法律词典》入选“2018年内蒙古十大法治事件”。
